La presencia de los átomos de nitrógeno le da un carácter básico a estos compuestos.
Son aromáticas y por lo tanto son planas, también son insolubles en agua y pueden establecer interacciones hidrofóbicas entre ellas; estas interacciones sirven para estabilizar la estructura tridimensional de los ácidos nucleicos.
La existencia de distintos radicales hace que puedan aparecer varias bases nitrogenadas, las cuales son: