Si en la secuencia de bases escrita a partir de la adenina +1 sustituimos las T por U, tendríamos la secuencia del ARN transcrito primario.
El elemento central de la regulación de la transcripción es el promotor, que se define como un segmento de ADN; este contiene las señales para la unión adecuada de la holoenzima de la ARN polimerasa y su posterior activación para formar un sitio capaz de iniciar la transcripción.
El promotor contiene, además, en sí o en sus alrededores, otras señales que controlan la unión específica de las proteínas reguladoras; estas proteínas modulan la efectividad de la unión de la polimerasa con el promotor.