Con el desarrollo de métodos filogenéticos, ahora es más sencillo separar el componente filogenético de variación, de la variación producto de la función.
Algunos de los beneficios de la sistemática son; el descubrimiento de nuevas cosas (como medicinas, alimentos, etc.), la predicción de nuevas cosas y agregar información que conocemos acerca de los organismos, incluyendo sus usos.
Uno de los problemas más graves que ha enfrentado la Sistemática radica en que sus bases se originaron en el sistema Linneano de clasificación.
Resulta un problema porque este sistema fue concebido en un mundo en donde no existía el concepto de evolución sino el de creación.
